Selain diselenggarakannya program Home Visit dan Pembinaan Pagi yang diperuntukkan bagi seluruh siswa kelas 6, program Pembinaan Sore pun dilaksanakan guna meningkatkan pemahaman siswa siswi SD Muhammadiyah Condongcatur terhadap materi-materi pelajaran yang diujikan dalam USBN. Kegiatan pendalaman materi ini, melibatkan seluruh siswa kelas 6 beserta para guru yang mengampu tiga mata pelajaran yang diujikan di USBN yakni Bahasa Indonesia, Ilmu Pengetahuan Alam (IPA) dan Matematika berjumlah 12 orang guru. Kegiatan tersebut dilaksanakan secara rutin tiga kali dalam seminggu yaitu pada hari Senin, Rabu dan Kamis pukul 14.30 sampai 16.00 WIB.

Kegiatan yang diikuti seluruh siswa kelas 6 SD Muhammadiyah Condongcatur ini dilaksanakan di beberapa ruang kelas yang telah ditentukan. Dalam pelaksanaannya, siswa siswi dibagi menjadi 12 kelompok yang terdiri dari empat kelompok mata pelajaran Bahasa Indonesia, empat kelompok mata pelajaran IPA dan empat kelompok mata pelajaran Matematika. Setiap kelompok didampingi oleh masing-masing guru bidang studi. Dibaginya siswa siswi dalam beberapa kelompok yang lebih kecil dalam kegiatan Pembinaan Sore, diharapkan dapat memberikan pengalaman belajar yang lebih intensif dan penyampaian materi yang lebih terarah dari masing-masing pendamping ke para siswanya.